Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5dQ62240 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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