Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha7Q61772 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha7Q61772 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms