Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms