Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcd2Q61285 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcd2Q61285 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcd2Q61285 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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