Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms