Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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