Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CttnQ60598 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms