Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms