Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms