Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms