Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms