Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim58Q5NCC9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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