Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spsb3Q571F5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spsb3Q571F5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spsb3Q571F5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms