Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf608Q56A10 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms