Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc47Q505F5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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