Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms