Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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