Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E330014E10RikQ3UL33 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E330014E10RikQ3UL33 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E330014E10RikQ3UL33 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E330014E10RikQ3UL33 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms