Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms