Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms