Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms