Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms