Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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