Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms