Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms