Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy4Q3TYX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms