Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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