Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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