Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp39Q3TIX9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms