Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stt3bQ3TDQ1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms