Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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