Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms