Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms