Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms