Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1bQ0MW30 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neurl1bQ0MW30 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms