Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms