Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms