Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms