Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf3Q07104 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms