Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms