Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms