Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms