Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms