Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms