Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms