Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PrkcqQ02111 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms