Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms