Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms