Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms