Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms